“海峡两岸气候变迁与能源可持续发展论坛”的前身是“两岸能源与环境永续发展科技研讨会”，是2005年由两岸学者共同发起并积极促成的一项由两岸高校交替承办的高水准学术交流活动。2009年10月与会人员在台湾成功大学达成共识，将研讨会名称改为现名。论坛在大陆和台湾分别设立理事会，由中国工程院能源与矿业工程学部与台湾永续能源研究基金会联合主办。2013年，在台湾首次举行了“两岸能源产业高峰会”，2014年4月“海峡两岸气候变迁与能源可持续发展论坛”大陆方面理事会特别会议决定：从2015年开始，论坛大陆主办单位变更为气候变迁与能源可持续发展研究院。2020年，为了应对新冠疫情影响，论坛创新性实施了线上线下相结合的方式，使论坛得到有效延续。

论坛自2005年首次举办以来，历经近二十年的发展，已有百余名中国工程院院士、中国科学院院士，以及约千余名两岸各界知名人士、大学校长、专家学者参加了论坛，已成为两岸能源与环境领域专家学者重要的学术交流平台，在两岸科技界、教育界和产业界的影响日益扩大。